Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPC1L1Q9UHC9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPC1L1Q9UHC9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms