Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA6Q9UF33 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms