Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFDP1Q9UEE9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFDP1Q9UEE9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms