Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPG2Q9UBF2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms