Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MARCH4Q9P2E8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MARCH4Q9P2E8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms