Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ABCF3Q9NUQ8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms