Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF275Q9NSD4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF275Q9NSD4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms