Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASS4Q9NQ75 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASS4Q9NQ75 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms