Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHX9Q9NQ69 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX9Q9NQ69 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms