Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IL1RAPQ9NPH3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IL1RAPQ9NPH3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms