Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KIAA1549Q9HCM3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms