Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGR6Q9HBX8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms