Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NYXQ9GZU5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NYXQ9GZU5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms