Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LNPKQ9C0E8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms