Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXQ1Q9C009 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXQ1Q9C009 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXQ1Q9C009 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXQ1Q9C009 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FOXQ1Q9C009 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FOXQ1Q9C009 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXQ1Q9C009 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXQ1Q9C009 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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