Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLRP1Q9C000 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms