Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDAC8Q9BY41 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDAC8Q9BY41 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms