Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VN1R3Q9BXE9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VN1R3Q9BXE9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms