Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAGR1Q9BTK6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PAGR1Q9BTK6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAGR1Q9BTK6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAGR1Q9BTK6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAGR1Q9BTK6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAGR1Q9BTK6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAGR1Q9BTK6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAGR1Q9BTK6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAGR1Q9BTK6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PAGR1Q9BTK6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAGR1Q9BTK6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms