Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TINF2Q9BSI4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TINF2Q9BSI4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms