Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNS3Q9BQ31 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNS3Q9BQ31 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms