Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms