Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATF6BQ99941 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATF6BQ99941 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms