Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRG3Q99928 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms