Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DCLRE1CQ96SD1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms