Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRRC1Q96M27 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms