Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms