Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TPD52L3Q96J77 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TPD52L3Q96J77 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms