Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA3Q96EY1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA3Q96EY1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms