Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX21Q969T3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms