Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP9XQ93008 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP9XQ93008 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP9XQ93008 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP9XQ93008 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP9XQ93008 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP9XQ93008 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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USP9XQ93008 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9XQ93008 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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