Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRG4Q92954 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms