Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC4Q8WW27 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms