Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEMA6DQ8NFY4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEMA6DQ8NFY4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms