Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH4

NUP37, Nucleoporin Nup37, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP37Q8NFH4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP37Q8NFH4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms