Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC191Q8NCU4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms