Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF550Q7Z398 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms