Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRCQ7RTU9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms