Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXD4L3Q6VB84 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms