Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC171Q6TFL3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms