Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMOD2Q6P5Q4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMOD2Q6P5Q4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms