Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 TIMM23B-204ENST00000483296 1156 ntTSL 213.96□□□□□ -0.174e-9■■■■■ 31.5
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PRPF8Q6P2Q9 TIMM23B-203ENST00000478381 2623 ntTSL 28.96□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 31.5
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PRPF8Q6P2Q9 PBRM1-209ENST00000412587 4766 ntTSL 1 (best)6.97□□□□□ -1.296e-7■■■■■ 31.4
PRPF8Q6P2Q9 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 31.4
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PRPF8Q6P2Q9 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.526e-7■■■■■ 31.4
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