Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG16L1Q676U5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms