Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms