Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOGA3Q5TF21 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms