Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTXN3Q4LDR2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms