Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TTLL9Q3SXZ7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TTLL9Q3SXZ7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms