Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP21-3Q3LHN1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms