Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UVSSAQ2YD98 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms