Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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